Фінансування Головного управління ДПС у Закарпатській області здійснюється відповідно до Порядку складання, розгляду, затвердження та основних вимог до виконання кошторисів бюджетних установ, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 28.02.2002 № 228 (зі змінами).
Структура та обсяг бюджетних коштів Головного управління ДПС у Закарпатській області згідно затверджених кошторисів на 2023 рік (зі змінами) за окремими програмами по загальному фонду складає 175`950`700,00 гривень, в тому числі:
1. За бюджетною програмою 3507010 «Керівництво та управління у сфері податкової політики, у розмірі 175`133`400,00 гривень. Фактичне фінансування на січень-травень 2023 року становило 61`606`960,00 гривень, або 35,1 % від затвердженого кошторису.
1.2. За бюджетною програмою 3507090 «Виконання судових рішень на користь фізичних та юридичних осіб» у розмірі 817`300,00 гривень. Фактичне фінансування на січень-травень 2023 року становило 190`418,00 гривень, або 23,3% від затвердженого кошторису.
2. Кошти спеціального фонду – 117`000,00 гривень.
Основним джерелом формування дохідної частини спеціального фонду є власні надходження, а саме, надання приміщень в оренду нерухомого майна бюджетної установи, що обліковується на балансі Головного управління ДПС у Закарпатській області.
Враховуючи вимоги Постанови Кабінету Міністрів України від 27.05.2022 № 634 «Про особливості оренди державного та комунального майна у період воєнного стану», надходження коштів від здачі в оренду майна за період січень-травень поточного року становить 21`128,67 гривень, або 18,0 % від затвердженого кошторису.